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1985年作出《关于科技体制改革的决定》(下称决定),揭开了全面科技体制改革的序幕。曾参与制定这一政策的吴明瑜说,这个改革决定的基本点是要适应市场经济的要求,承认技术的商品属性,开拓技术市场,促进技术和经济的结合。改革科技事业拨款制度是决定中极为重要又非常具体的改革措施。它的目标是在保证科技经费不断增长的前提下,既要保证基础研究和公益性研究服务的经费,同时又鼓励从事技术开发的机构和科技工作者,通过市场化手段创造收入、增加开发经费,促进科技工作更好地同经济工作结合,即后来归纳的“稳住一头,放开一片”的政策。
在此期间,加大了对科学基础研究工作的重视力度,建立国家自然科学基金制,恢复职称评定,加强中科院建设,建立博士后制度,建设国家重点实验室等。1988年,我国又先后批准建立了53个国家高新技术产业开发区,先后制定了“星火计划”、“863计划”、“火炬计划”、“攀登计划”、重大项目攻关计划
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